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在真核生物中和性別相關的一類染色體，叫做性染色體。性染色體為決定個體雌雄性別，哺乳動物的性染色體是以X和Y表示，X染色體較大，攜帶的遺傳信息多於Y染色體。

人類的性染色體是總數23對染色體中的其中1對，擁有兩個X染色體的是女性，擁有X和Y染色體各一個的個體是男性。

某些疾病與性染色體的數目異常有關係，如唐納氏綜合徵，有些僅由出現於X染色體基因控制遺傳性狀的，例如血友病、紅綠色盲，稱為性聯遺傳，性聯遺傳在男性出現的頻率多於女性。

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