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原發性骨髓纖維化的發病原因尚未明確，但在50%左右的骨髓纖維化患者里，發現JAK2V617F基因突變，現在認為JAK2基因通路的突變是導致骨髓纖維化的原因。基因突變造成細胞因子分泌失常，一些成纖維細胞，在細胞因子的刺激下過度增生，取代了骨髓的造血組織，導致患者發病。

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