植物神經紊亂的診斷需要排除器質性疾病，通過心臟、消化、泌尿系統檢查，還有腦檢查，排除器質性問題，臨床表現有失眠、頭痛、頭脹、腦鳴等症狀，還會出現脾氣暴躁、神經衰弱以及消化系統、泌尿系統、中樞神經系統、心臟系統的臨床表現。

通過各種檢查，沒有產生器質性的結果，有強迫症狀、焦慮症狀、恐懼症狀和疑病症狀等，但沒有找到器質性原因，同時持續時間在2-3個月以上就可以診斷為植物神經功能紊亂。

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