男性支原體、衣原體常常通過分泌物檢查，如病人發生支原體或衣原體引起的非淋菌性尿道炎時，病人常常會出現尿道隱痛、尿道發癢或尿道口少許分泌物。

通過尿道口分泌物培養常常能發現有無支原體或衣原體感染。男性支原體、衣原體感染還可以通過精液培養來完成，通過精液支原體培養和衣原體培養常常能找到致病微生物。

通過選擇有效的抗生素，如鹽酸多西環素、阿奇黴素分散片等序貫治療四周左右，多數病人支原體、衣原體感染症狀會徹底好轉。

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