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慢性肝炎的病因有多種，包括病毒性肝炎、酒精性肝炎、非酒精性脂肪性肝炎或者由藥物引起的慢性肝炎、自身免疫性的肝炎。

由於我國是B肝大國，B肝攜帶者眾多，很多慢性肝炎的患者都是B肝導致，C肝也可以導致慢性肝炎。B肝和C肝都容易導致慢性肝炎，最後肝纖維化、肝硬化甚至出現肝癌。

其他原因例如飲酒、脂肪肝或者自身免疫性的肝炎也會引起慢性的肝炎。因此出現慢性肝炎需要至肝病門診，明確肝炎的原因，進行對因治療。

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