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慢性B型肝炎是一種慢性疾病，屬於終身疾病，目前沒有藥物能夠根治慢性B型肝炎。對於慢性B型肝炎，主要的治療是針對病因治療，即針對B型肝炎病毒的治療。目前抗病毒藥物只能最大程度抑制病毒複製，比如常用的恩替卡韋和替諾福韋等藥物，使病人體內的B肝病毒在較低水平或者無法測出，能夠控制肝炎，避免反覆發作。避免因反覆發作肝炎，而形成肝纖維化、肝硬化以及肝硬化併發症，包括肝癌等，具有控制慢性B型肝炎病程的作用。

如果患者有轉氨酶升高以及黃疸升高，可以通過保肝、退黃、降酶等藥物，達到肝功能完全正常的水平。C型肝炎和B型肝炎不同，目前C型肝炎已經有較好的抗C肝病毒藥物，患者可以通過抗C型肝炎病毒的治療，徹底清除體內的C型肝炎，達到治癒。對於B型肝炎患者，屬於終身疾病，需要定期檢查。如果患者符合抗病毒治療指征，需服用抗病毒藥物，之後定期檢查，爭取長期將B型肝炎病毒控制在較低水平或者無法測出，避免發生肝纖維化、肝硬化，甚至肝癌。