第二代試管嬰兒主要是直接將精子注入到卵母細胞的胞漿當中，達到輔助懷孕的目的，在臨床上使一些男性不孕症的患者達到了懷孕的目的。在臨床上主要適合於嚴重的少精、弱精、精子畸形，另外不可逆的梗阻性無精子症、生精功能障礙、免疫性不孕、體外受精失敗的病人，或者精子頂體異常，都可以用第二代試管嬰兒技術來達到懷孕的目的。

在臨床上二代試管嬰兒也存在一定的缺陷，比如因為違背了自然受精的生物法則，就存在比較大的遺傳風險，所以在做二代試管嬰兒之前要了解基本的狀況。

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