頭顱超聲用於顱內疾病的診斷，頭顱超聲檢查使用的是聲波反射，拍攝大腦及其腦內液體腔的影像。這項檢查通常用於嬰兒，可用來篩查早產兒、18個月以下嬰兒的大腦和腦室存在的問題。

超聲波不能穿過骨骼，一旦顱骨長在一起，就無法使用超聲波檢查大腦，因此顱腦超聲檢查可用於顱骨尚未生長在一起的嬰兒，也可以用於成人開顱手術中檢查大腦組織，主要是通過超聲檢查判斷嬰兒的發育情況，以及顱內是否有先天性的占位性病變或者是腦膿腫、腦血管發育畸形、動脈狹窄、先天性肌纖維發育不良、鎖骨下動脈盜血綜合徵等等。

臨床最主要的包括頸動脈超聲和經顱的都卜勒超聲檢查，目前隨著醫療水平逐漸的提高和改進，對腦動脈血流中非栓子的監測、顱內壓的增高及判斷也有著重要的臨床意義和價值，因此對於許多病人而言，頭顱的超聲檢查是一種必備的項目，可以明確的篩查顱內相關的疾病，從而進行診斷、治療。