腦超聲主要是查腦血管病，有沒有存在動靜脈畸形、血管瘤、海綿狀血管瘤等等，可以通過超聲的回聲來判斷腦血管有沒有狹窄、硬化以及有沒有斑塊。還可以根據血流速度的快慢，來判斷腦血管是不是存在血管痙攣，以及血管硬化程度。

還可以通過腦超聲對血液循環里的微栓子監測，來判斷會造成中風的風險大小，同時還可以通過對微栓子的監測，來進行預防和治療腦血管病。所以腦超聲的檢查主要是看腦血管的狀態、狹窄程度、硬化程度和有沒有斑塊、痙攣，以及有沒有腦血管畸形、海綿狀血管瘤、血管瘤等狀況。