因胰腺部位特殊，較少進行活檢，一般僅採取胰腺穿刺以明確腫瘤性質。對於內分泌腫瘤等胰腺疾病的病理診斷一般要求較高，並且由於其穿刺獲得組織較少，除細胞學檢查外，還需行組織學檢查。

此外，胰腺手術易造成胰瘺的發生，穿刺時獲取的組織較少，首先選擇活檢檢查，若無法活檢，則進行細胞塗片，根據細胞形態進行初步判斷，必要時再手術證實。