非常多的原因可以導致長不高,首先是生長激素缺乏症,由於特發性的生長激素缺乏或繼發於下丘腦-垂體的腫瘤,最常見的是顱咽管瘤。神經纖維瘤顱內的感染,比如腦炎、腦膜炎、肉芽腫、疾病創傷,放射性損傷也可影響下丘腦-垂體的功能,造成繼發性的生長激素缺乏。生長激素有些人並不缺乏,但是生長激素不能起到應有的作用,叫生長激素不敏感綜合徵。

如果是全身性的兒童期,心臟、肝臟、腎臟、胃腸、慢性疾病或慢性的感染,甚至腫瘤性的疾病,也可以導致生長發育障礙。有些人青春就發育延遲,生長發育較同齡兒童延遲,16-17歲仍然沒有開始發育。嬰兒身材矮小但智力正常,如果甲狀腺功能減退,發生在胎兒和新生兒可以出現明顯的生長發育障礙,叫呆小症。先天性的卵巢發育不全綜合徵,也叫特納綜合徵,是一種缺失X染色體而引起的先天性性分化異常疾病,主要是女性,可以出現生長發育受影響身材矮小。

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