陰囊型尿道下裂的特點是尿道的開口位於陰莖根部與陰囊交界處，陰莖向腹側屈曲畸形，陰莖背側的包皮正常，而陰莖腹側的包皮缺乏，因此形成帽狀包皮，尿道海綿體發育不全，從陰莖系帶部延伸到異常尿道的開口，形成一條粗的纖維帶。

陰囊型尿道下裂可以影響到性功能和性行為，生活中需要取坐位排尿，洗澡時迴避別人看見畸形生殖器等，而給病人心理上帶來障礙。另外，由於性生活的不方便，精液不能排入陰道，也會造成不育症，所以陰囊型尿道下裂需要做整形手術，以恢復正常站立排尿和成年後能夠進行性生活。手術應該在學齡期之前實行，可以一期或者分期完成。