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喉嚨皰疹最多見的就是皰疹性咽峽炎，是由於柯薩奇病毒和腸道病毒引起的一種急性呼吸道的傳染性疾病。病人通常是在6歲以下的兒童，成年人可以散發。病人的臨床表現主要是有發熱，少數病人可以出現高熱、噁心、嘔吐、咽痛以及咽峽部的皰疹。

咽痛通常會影響進食，咽峽部的皰疹一般在1-2天皰疹形成破裂，一般1周可以痊癒。病人的治療首先要注意隔離，因為是一種呼吸道傳染性疾病，所以病人用過的物件及吃過的食物要進行嚴格的處理。

對於皰疹性咽峽炎病毒沒有特異性的抗病毒治療，可以在醫生的指導下用利巴韋林進行治療，同時應用干擾素進行局部的霧化或者噴入，通常這個疾病在1周左右可以痊癒。少數病人由於疾病比較重而引起了併發症，如腦膜炎、心肌炎等，可以造成很嚴重的危險，引起死亡。