顱內脊索瘤通常位於顱底部位，屬於局部擴展性腫瘤，最常見於蝶枕聯合的脊索殘留所造成。根據腫瘤部位可以分為鞍區、顱中窩和斜坡等三種類型。對於這類脊索瘤的手術，相對較為困難，主要是因為病變在顱底部位，經常包繞、累及重要的血管和神經，手術入路設計也會有一定困難，同時腫瘤質地比較堅硬，切除過程也會面臨更大的困難。因此，手術治療費用相對較高，一般需要4-8萬元。對於一部分脊索瘤難以通過手術全切，術後還需要進行放射治療，治療費用也會有相應的增加，甚至可多達10萬元以上。