用藥指南建議奧美拉唑空腹服用，可以餐前15-30分鐘服用。因為奧美拉唑屬於質子泵抑制劑，此類藥物主要作用於胃內泌酸壁細胞的氫-鉀-ATP酶，餐前服藥可以與進餐後所引起泌酸的高峰重疊。即藥物發揮較大作用的時間，與體內酸分泌所達到高峰的時間相結合，可以使奧美拉唑類抑酸藥物更好發揮作用，從而治療酸分泌過多等疾病。

通常奧美拉唑在臨床上用於胃炎、胃食管反流病、消化性潰瘍、卓艾綜合徵等胃酸分泌過多的疾病，主要起抑酸作用，可達到治療疾病目的。

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