膀胱鏡活檢是泌尿外科最常用的操作之一，其主要目的是直視下對膀胱和尿道腔內解剖學和大體病理進行觀察，並可獲取活檢標本，進行組織病理學檢查，來達到確診的目的。

同時也可以通過輸尿管插管，根據上尿路尿樣進行逆行造影來了解上尿路病變，從而作出臨床診斷。

因此，具有診斷和治療的目的，在診斷方面可以明確外科血尿的出血部位和原因，診斷膀胱尿道腫瘤，包括腫瘤的部位、大小、形狀，並取活檢，尿道膀胱移行上皮腫瘤保留膀胱手術後定期複查。

診斷尿尿道膀胱的結石、異物、畸形、狹窄，膀胱周圍臟器病變對膀胱的影響，以及上尿路逆行造影對上尿路疾病的診斷。

在治療方面，可以取出異物粉碎並取出較小的結石，通過輸尿管導管向腎盂灌注藥物治療乳糜尿，放置輸尿管導管或支架管來引流尿液，預防和治療輸尿管的狹窄。