中樞神經系統感染後果非常嚴重，最重的就會導致患者死亡，是最嚴重的結果，而且死亡率比較高，相比於其他系統感染，中樞神經系統感染死亡率最高。

再就是可以由於細菌、病毒，或者是微生物侵犯腦組織、腦細胞會遺留下有抽風等後遺症。另外，這些微生物也會造成顱底粘連，導致腦組織出現繼發性腦積水，或者顱內高壓的情況。所以，中樞神經系統感染和其他系統感染相比較，是非常嚴重的疾病。

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