男性生殖疾病涵蓋的範圍非常廣,主要包括以下門類,首先是性發育方面的疾病,主要是男性青春期發育延遲的問題。其次是陰莖與包皮的疾病,例如包皮過長與包莖、小陰莖與隱匿陰莖、陰莖的折斷及離斷損傷、陰莖硬結症、陰莖彎曲、陰莖異常勃起。

還有睪丸、附睪及精索的疾病,比如炎症與損傷,還有睪丸扭轉、隱睪症、睪丸腫瘤、精索靜脈曲張、鞘膜積液等。前列腺的疾病包括前列腺炎、前列腺增生、前列腺癌、男子的不育症、男子的性功能障礙,比如性慾障礙、勃起功能障礙、插入障礙、射精障礙以及男性計劃生育方面的問題,男性的更年期綜合徵和男性的生殖系統感染,也屬於男性生殖疾病的範疇。