女性小便有異味常常提示有泌尿系感染，當女性發生泌尿系感染時，尤其出現尿頻、尿急、排尿不盡時，由於殘餘尿內細菌和各種病原微生物繁殖，會出現尿液有特殊氣味。

女性小便有異味還見於真菌感染，當女性發生外陰或泌尿生殖道真菌感染時，也會出現尿道異味。還見於結腸膀胱瘺的病人，當發生直腸膀胱瘺時會有大便排入到尿液中，出現尿液中有惡臭氣味的現象，所以女性小便有異味要及時到泌尿外科就醫。

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