小孩心臟肥大的病因包括心臟後負荷增加、心肌病變、代謝物沉著等，具體如下：

1、心臟後負荷增加：出現心血管疾病，如血管狹窄，心肌需要用力收縮才能將血射出，心肌代償機制可以表現為心臟肥大，導致心臟後負荷增加。常見疾病為高血壓，如有先天性心血管疾病，患者主動脈弓縮窄會導致繼發性高血壓，出現心肌肥厚或全身疾病，多發性大動脈炎或者其他大動脈血管出現狹窄、閉塞，也可以導致心臟後負荷增加，小孩心肌肥大；

2、心肌病變：常見是肥厚型心肌病，一般是家族遺傳性疾病，發病原理主要是心肌基因突變，導致心肌纖維過度增生，合併心肌功能不良，而出現心肌肥厚表現；

3、代謝物沉著：體內的代謝物質在心肌發生異常沉著，如心肌澱粉樣變性，肝糖原或心肌糖原累積，或者粘多糖病，都可以產生代謝產物，在心肌造成不同程度的蓄積和沉積，會導致心臟或心肌肥大表現。