兒童房缺只要進行了開胸手術，肯定就會有相應的肺部併發症。因為必須要經過肺而到達心臟，肺可能會引起胸腔的病變。對有經驗或者操作較多的醫院和醫生，此風險已經非常小。

如果能夠通過血管進入而做房缺，相應的風險就更小。通過血管進入而做兒童房缺手術，有嚴格的適應證，並不是所有的房缺都適合微創的方法，即血管進入的方法做手術，只有部分病人適合。

還有一部分病人不適合血管進入，就必須去開胸，開胸就可能存在潛在的風險。但是現在的開胸方法，可以有正中開胸，也可以有右側腋下小切口的開胸。實際上大量的病人，還是選擇了右側腋下的小切口。因為其隱蔽性和傷口的美觀性，所以在臨床的應用過程中，非常安全。

到現在，此類手術基本上成功率應該接近100%，沒有相應的併發症和手術風險。