三叉神經痛常用的藥物是卡馬西平，卡馬西平的效果比較肯定，但是副作用也比較突出，最嚴重的會造成剝脫性的皮炎，甚至有生命的危險。

所以目前隨著醫學科學的發展，一些新型的藥物也已經出現。比如卡馬西平的升級藥物，有奧卡西平，對三叉神經的治療也有一定的作用。還有專門治療神經痛的藥物，包括加巴噴丁、普瑞巴林，通常也可以用於三叉神經痛的治療。

還有營養神經的藥物，因為根據三叉神經痛的病因，可能有一部分要進行營養神經，包括甲鈷胺、維生素B1，也可以改善三叉神經痛的症狀。還有一般的止痛藥，包括芬必得(布洛芬緩釋膠囊)、散利痛(複方對乙醯氨基酚)，對於部分患者三叉神經痛，也有一定的效果。

所以針對三叉神經的藥物治療，要結合病因，如果是病毒感染引起的三叉神經痛，需要抗病毒的治療。抗病毒的治療一般有帶狀皰疹病毒引起的三叉神經痛，給予最常用的阿昔洛韋、更昔洛韋、伐昔洛韋等，都可以改善三叉神經痛的症狀。