抗真菌的藥物種類很多有數十種，可以根據作用分成淺部真菌的藥物還有深部真菌的藥物。根據的作用機制可以分為作用於真菌細胞膜上的藥物，作用於真菌細胞壁上的藥物，還有抑制真菌核酸合成的藥物。

按照結構分類分成了三唑類的抗真菌藥物，像咪康唑、氟康唑、伏立康唑等等，多烯類的抗真菌藥二性黴素B，烯丙胺類的抗真菌藥物鹽酸特比萘芬、尼可黴素、氟胞嘧啶、灰黃黴素等等。

抗真菌的藥物種類非常多，包括我們中藥裡邊的土槿皮酊、大蒜製劑都有抑制或殺滅真菌的作用。

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