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MRI即核磁共振檢查，肝臟核磁共振檢查主要用於診斷肝臟占位性疾病。許多肝臟占位在發現時較小，常規超聲無法確診病灶的具體性質，可通過腹部核磁共振檢查，來判斷肝臟的病灶為良性還是惡性。

還可通過注射增強造影劑，來判斷病灶的血液供應特點、和周圍正常肝實質的反差，對於腫瘤的定性診斷非常重要。還可判斷腫瘤的具體位置、數量、大小，是否侵犯周圍的血管。

肝臟核磁共振檢查對於肝內膽道系統診斷，也非常有價值。正常情況下膽道系統不會擴張，當膽道存在梗阻，如結石、炎症、腫瘤，會引起肝內膽管擴張、膽管壁強化、異常軟組織陰影、膽道內充盈缺損等，以上信號均可在肝臟核磁共振上清晰地顯示。