原發性腦幹損傷的臨床症狀，可能有很多的表現，根據損傷的不同的部位，有具體不同的表現。

1、所有運動感覺的神經傳導束都要經過腦幹，所以無論腦幹什麼部位損傷，都可能損傷運動感覺的纖維，可以出現運動障礙、偏癱、四肢癱、雙下肢癱；

2、可以出現感覺的障礙，腦幹是交叉性的感覺障礙，頭面部是一側，肢體是對側這種感覺障礙；

3、腦幹有很多神經核團，神經核團也會有損傷，會有不同的表現。12對無神經的核團都在腦幹，都可以有不同程度的損傷，哪個神經核團的損傷，就表現為哪個地方的臨床表現；

4、腦幹還有上行網狀激活系統，一旦損傷，就會導致患者出現昏迷；

5、生命中樞在腦幹，腦幹損傷了之後，會導致心跳、呼吸停止，發生死亡。