胃腸穿孔因為位置、大小、時間不同，表現也不盡相同。最常見的胃腸穿孔主要是胃十二指腸穿孔，由於胃酸穿孔導致膽汁和胃液，具有強酸、強鹼的液體通過穿孔部位，進入局部組織和腹腔內，產生劇烈疼痛，主要表現為刀割樣疼痛，同時患者有明顯的噁心、嘔吐、大汗淋漓、面色蒼白，甚至休克的表現。由於患者疼痛劇烈，有些患者控制不住疼痛，蜷曲而不能伸直，此時肚子摸上去較硬，稱之為板狀腹。板狀腹為明顯的腹膜炎體徵，呈壓痛及反跳痛。

小腸穿孔和結腸穿孔較少，但也存在，小腸穿孔的表現與胃穿孔的表現類似，但沒有那麼劇烈。結腸穿孔多發生於老年人，有可能因為先天性因素，或腫瘤所引起的穿孔，穿孔發生比較緩慢，有可能隔了好幾天才來，而且因為腸液不具有強酸、強鹼，所以不是急性發作，但是穿孔以後，炎症、細菌感染加重，症狀反而越來越重，所以胃腸道穿孔需要急診手術去干預。