通常任何手術正常人均會有疼痛，寶寶多指手術同樣會有疼痛現象，但疼痛並不特別劇烈。多指手術需要將多指去除，由於存在創面，所以寶寶會有疼痛，但是疼痛程度因人而異。

由於寶寶神經末梢未發育完善，疼痛與成人疼痛不同，可能比成人疼痛感覺慢且不明顯。比如寶寶接種預防針時，有時寶寶哭並不是針扎進去時，通常是針拔出時開始哭，因為此時痛覺才到達大腦，所以寶寶疼痛並非想像當中劇烈。