臨床上容易混淆的結核和腫瘤，常見的是淋巴結腫大和肺部腫瘤。淋巴結腫大常見淋巴結炎、淋巴結核、淋巴瘤和淋巴結的轉移癌。

淋巴結核常見淋巴結腫大，是融合性淋巴結腫大，質地比較硬而且會出現疼痛的症狀，會化膿，惡性腫瘤引起的淋巴結腫大不會融合，而且是無疼痛性的。

肺結核和肺惡性腫瘤的鑑別比較困難，主要通過細菌培養或者手術切除做病理診斷才能進行區別。

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