指甲里有細小的短黑線是指甲里有黑色素，這種黑色素既可能是甲母質產生的，也可能是甲床、甲母質炎症產生的色素沉著、或者是甲板本身有真菌、細菌的感染，產生的色素。

指甲是從甲母質長出來，沿著甲床往前爬行。如果甲母質長了色素痣叫甲母痣，會產生色素，隨著之前往前爬行，帶出黑色的細線，可能是甲床或者是甲母質有炎症。

形成炎症後的色素沉著，也會隨著指甲生長產生細細的黑線。具體是什麼原因造成的，要根據仔細詢問病史，還有皮膚鏡檢查可以診斷。

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